본 지침서에 수록되어 있는 판별법은 가짜식품 등에 대한 식품원료를 확인하는 방법으로 이화학적인 분석법도 있으나 더 정밀한 방법을 위하여 유전자 분석법을 마련하였다.

원료농산물 또는 단순 가공식품의 경우 일반프라이머 또는 종 특이 프라이머를 사용하는 방법 모두 적용이 가능하나, 가공식품의 경우 제조·가공 시 가열, 압력 등에 의하여 추출유전자의 크기가 작아지기 때문에 종 특이 프라이머를 사용하는 방법을 선택하였다. Ⅰ. 시료 전처리 및 유전자 추출
1. 시료 전처리
2. 유전자 추출
3. 추출 유전자 확인

Ⅱ. 종 특이 프라이머를 이용한 유전자 증폭(PCR)
Ⅱ-Ⅰ. 동물성 원료
1. 가축류(소, 돼지, 양, 염소, 사슴, 말, 캥거루)
2. 가금류(닭, 오리, 칠면조, 타조, 거위)
3. 민물어류[잉어(향어), 붕어, 미꾸라지, 미꾸리, 가물치]
4. 해양어류(대구, 청대구, 명태, 틸라피아, 꽁치, 고등어, 다금바리, 자바리, 능성어)
5. 회유어류(연어 및 송어)
6. 다랑어류 및 새치류
7. 심해성어류(기름갈치꼬치 및 흑갈치꼬치)
8. 갑각류(게 및 새우)
9. 패류(전복, 백합, 소라)
10. 두족류(오징어, 한치, 주꾸미, 낙지)
Ⅱ-Ⅱ. 식물성 원료
1. 곡류(쌀, 밀, 메밀)
2. 서류(고구마 및 타피오카)
3. 콩류(검정콩)
4. 견과 종실류(땅콩, 참깨, 들깨, 올리브, 아몬드, 해바라기)
5. 과실류(복숭아, 딸기, 앵두, 포도)
6. 채소류[배추, 파(쪽파), 토마토, 호박]
7. 근채류(인삼, 더덕, 도라지, 마, 마늘, 양파, 무, 생강, 당근)
8. 기타(녹차, 시금치, 클로렐라, 태국칡)

Ⅲ. 일반(universal) 프라이머를 이용한 유전자 증폭(PCR)
Ⅲ-Ⅰ. 동물성 원료
1. LCO1490/HCO2198 프라이머를 이용한 방법
2. VF2/FISH R2 프라이머를 이용한 방법
3. L14724/H15915 프라이머를 이용한 방법
Ⅲ-Ⅱ. 식물성 원료
1. trnH/psbA 프라이머를 이용한 방법
2. rpoB 프라이머를 이용한 방법
3. rbcL 프라이머를 이용한 방법

Ⅳ. 유전자 증폭산물의 확인
1. 전기영동에 따른 결과의 판정

Ⅴ. 유전자 증폭산물의 결과 판정
1. 결과 판정

Ⅵ. 참고문헌

Ⅶ. 부 록

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